Qgenomics

Genomics for human health

qCell Identity

El servicio qCell Identity está pensado para:

  • la identificación de linias celulares
  • la detección de contaminación cruzada con otros tipos celulares.

El estudio se realiza mediante marcadores de tipo microsatélite. La combinación de nueve microsatélites produce un perfil genético con una probabilidad de coincidencia por azar de 1 en 2.92x10^9.

Identifica tus lineas celulares!!!

La autentificación de lineas celulares es un requisito evidente y de importancia cabal para los investigadores. Se estima que entre un 15 y un 20% de las células que se utilizan en investigación biomédica están mal identificadas y/o presentan contaminación cruzada[1]. A pesar de esto, muy pocos investigadores verifican la identidad de sus lineas celulares. Estos fenómenos pueden explicar resultados no reproducibles e inconsistentes, afectan seriamente la calidad de las publicaciones científicas (llegando a ser motivo de retracción de artículos!), representan un riesgo potencial para la salud y, sobretot, el efecto más inmediato es una pérdida de tiempo y dinero ingente. Conscientes de estos peligros, desde hace algun tiempo, algunas de las revistas de mayor impacto como Clinical Cancer Research o Nature, exigen información sobre la identificación de las lineas celulares empleadas en los estudios antes de su publicación.
 
 

¿Cuando es preciso testar las células?

  • En los primeros pases tras haberlas adquirido o generado una nueva linea celular.
  • Como medida rutinaria de control de calidad antes de empezar un experimento.
  • Antes de una publicación.
  • Cuando se observa un comportamiento anómalo de la linea.
  • Para establecer el perfil genético de una nueva linea celular.[2].
 

Resultados del qCell Identity

El resultado del estudio consiste en un perfil del tamaño de los alelos para los nueve microsatélites analizados. Se usan las bbdd públicas para comparar este perfil con los perfiles de las lineas celulares depositadas y distribuidas por los principales bancos de lineas celulares (DSMZ, ATCC, ECCAC...), lo que permite la identificación de la lineas celular aportada por el cliente.
 
Este servicio sólo es aplicable a células de origen humano. Si se sospecha de la existencia de contaminación cruzada con células de otras especies (típicamente roedores), conviene utilizar otras aproximaciones. En caso de existencia de contaminación cruzada con otras células humanas, la detección es posible a partir de un grado de contaminación entre el 1 y el 5%.
 
Dada la inestabilidad inherente de los microsatélites, es probable que con los subcultivos el patrón varíe ligeramente, de manera que es recomendable testar las células de manera periódica para detectar este fenómeno.

Así funciona: simple y rápido!!!